fa استخراج سریع DNA ژنومی استافیلوکوکوس اورئوس توسط دترجنت های رخشویی و ارزیابی کارایی این DNA در انجام فرایندهای پائین دستی با استفاده از PCR تحقيقي Original Paper چکیده زمینه و هدف: جداسازی DNA ژنومی از سلول های باکتریایی از جمله فرایندهایی است که به طور معمول در اکثر آزمایشگاه های بیولوژیک انجام می گیرد و لذا برای آن روش های گوناگونی به صورت دستی و استفاده از کیت ارایه شده است، اما این روش ها ممکن است وقت گیر و هزینه بر باشند. در این مقاله جهت دستیابی به روشی سریع و کم هزینه استخراج DNA ژنومی باکتری استافیلوکوکوس اورئوس با استفاده از تعدادی از برند های دترجنت های رختشویی موجود در ایران مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: برندهای تاژ از نوع 5 آنزیم و برند سافتلن از نوع 3 آنزیم ، برندهای دریا و پاک فاقد آنزیم در غلظت های 5 ، 10، 20، 40، 80 میلی گرم در لیتر مورد استفاده قرار گرفتند. در ادامه جهت بررسی کارایی DNA استخراج شده در انجام فرایندهای پائین دستی، تست PCR اختصاصی برای ژن femA موجود در ژنوم باکتری استافیلوکوکوس اورئوس انجام گرفت. یافته‌ها: بررسی DNA استخراج شده توسط غلظت های مختلف برندهای مورد آزمایش نشان داد که محصول بدست آمده با استفاده از غلظت mg/lit40 پودر برند تاژ و سافتلن، دارای مناسب ترین نتیجه از نظر دو شاخص غلظت (µg/ml) و خلوص (A260/A280) DNAمی باشد که قابل مقایسه با نمونه های بدست آمده از روش دستی و کیت است. این شاخص ها به ترتیب 5/387 و 88/1 (تاژ)، 1/254 و 80/2 (سافتلن)، 6/396 و 95/1(دستی) و 3/423 و 2/2 (کیت) بود. در ادامه نتایج PCR انجام گرفته با استفاده از این DNA ها نشان داد که استخراج ژنوم با استفاده از دترجنت های رخشویی هیچ تاثیری بر روی کارایی آن به منظور استفاده در فرایندهای پائین دستی ندارد. نتیجه گیری: از یافته های این تحقیق می توان نتیجه گرفت که از غلظت های مناسب دترجنت های رخشویی می توان به منظور استخراج DNA ژنومی با راندمان مشابه روش های استخراج دستی و کیت استفاده نمود. واژه های کلیدی: استخراج DNA ، پودر رخشویی، ژنوم باکتریایی، واکنش زنجیره پلی مراز Abstract Background and objectives: Genomic DNA extraction of bacterial cells is of processes performed normally in most biological laboratories therefore, various methods have been offered, manually and kit, which may be time consuming and costly. In this paper, genomic DNA extraction of Staphylococcus aureus was investigated using some laundry detergent brands available in Iran to achieve a rapid and cost effective method. Material and Methods: five-enzyme Taj brand, three-enzyme Saftlan brand ,and Darya and Pak brands without enzyme were used in the concentrations of 10, 20, 40, 80 mg/L. Afterwards, in order to evaluate the efficiency of extracted DNA in downstream processing, PCR test was performed for femA gene in the genome of Staphylococcus aureus. Results: DNA extraction using different concentrations of the brands show that extracted DNA using 40 mg/L Saftlan and Taj brand powders have the best results according concentration (µg/ml) and purity (A260/A280) parameters. These parameters are 387.5 1.88 (Taj), 254.1 2.80 (Softlan), 396.6 1.95 (Manual) and 423.3 2.2 (Kit), respectively. Afterward, the PCR test results by show that DNA extraction using laundry detergents has no effect on its efficiency in order to be used in downstream processes. Conclusion: These results indicate that the proper concentrations of laundry detergents can be used to extract genomic DNA with similar efficiency to kit and manual extraction methods. Key words: Bacterial genome, DNA extraction, laundry powder, PCR, Staphylococcus aureus استخراج DNA ، پودر رخشویی، ژنوم باکتریایی، واکنش زنجیره پلی مراز Bacterial genome, DNA extraction, laundry powder, PCR, Staphylococcus aureus 35 42 http://mlj.goums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-110&slc_lang=fa&sid=1 Mousazade moghadam M مهرداد موسی زاده مقدم 10031947532846001075 10031947532846001075 No M.Sc. in Genetics, Biotechnology Research Center of Applied Medical Sciences مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی کاربردی Babavalian H حمید باباولیان 10031947532846001076 10031947532846001076 No PhD student in Medical Biotechnology, Biotechnology Research Center of Applied Medical Sciences مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی کاربردی Mirnejad R رضا میرنژاد rmirnejadreza@yahoo.com 10031947532846001077 10031947532846001077 Yes Ph.D. in Medical Bacteriology, Molecular Biology Research Center, مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، Shakeri F فاطمه شاکری 10031947532846001078 10031947532846001078 No M.Sc. in Plant Biotechnology Research Center of Applied Biotechnology مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی کاربردی،